أنشئت كلية الشريعة ، بموجب قرار مجلس أمناء جامعة مؤتة، عام 1999، وقد سبقها إنشاء قسم الشريعة والدراسات الإسلامية، الذي كان تابعاً لكلية الآداب، وأصبحت كلية الشريعة بعد الانتقال من القسم إلى الكلية، وتحوي قسمين في مرحلة البكالوريوس هما :
- الفقه وأصوله
- أصول الدين
وتحوي أيضا على ماجستير في الفقه وأصوله وآخر في أصول الدين كما تحوي على دكتوراه في الفقه وأصوله وللكلية تعاون وتـنسيق مع المؤسسات العلمية والأكاديمية العالية والدوائر الحكومية، حيث نظّمت العديد من المؤتمرات والأيام العلمية بالتعاون مع المعهد العالمي ووزارة الأوقاف وغيرهما ويشارك الكادر الأكاديمي في نشاطات الجامعة وخطب الجمعة والمناسبات المختلفة
- طلبة الشعوب الإسلامية
وتستوعب الكلية كل عام ، مجموعة من طلبة الشعوب الإسلامية ، من ماليزيا ، وأندونيسيا ، والفلبين وتايلند، وتركيا والصين وتوليهم رعاية خاصة في دراسة اللغة العربية، وعلوم الشريعة الإسلامية .
وتقدم برامج علمية في الدراسات العليا لعدد من طلبة دول الخليج العربي
 
فلسفة الكلية
تؤمن الكلية بمنهج التوسط والاعتدال في الدعوة إلى الإسلام ، وبقيم التسامح ، والحوار والتـفاعل مع الحضارات ، والثـقافات الأخرى .